Опция влияет на то, какое количество секунд каждый веб-хук будет находится в кеше и игнорироваться. К примеру у вас пришло два подряд веб-хука из МойСклад на один и тот же товар с интервалом 3 секунды. Первый веб-хук обработается, а второй уже нет, т.к. он будет в кеше (который длится 5 сек).