Функция профилей обмена
Модуль имеет возможность создавать разные профили обмена. По факту в админке это выглядит так, как будто у вас установлено несколько модулей и настройки профиля это по-сути настройки отдельного модуля.
Сейчас эта функция скрыта и скоро будет доступна в интерфейсе настроек модуля.
Функцию можно включить в 3 шага:

Выполнить код в командной PHP строке.

Адрес командной PHP-строки относительно вашего сайта:
/bitrix/admin/php_command_line.php?lang=ru
Вставляете код ниже в строку и выполняете его.
\Bitrix\Main\Config\Option::set('stocksprofiles', 'profiles_on', 'Y', false);
После этого функционал профилей будет доступен в модуле.

Включаем сам профиль

Для этого переходим в настройки модуля и дописываем в адресной строке браузера текст:
&profile_id=1
Итого у вас получится адрес:
/bitrix/admin/settings.php?lang=ru&mid=rbs.moyskladstocks&profile_id=1
Цифра в конце строки в этом адресе будет являться ID профиля (их можно настраивать бесконечно, но учитывайте нагрузку на АПИ МойСклад и на нагрузку БД сайта).

Добавляем адрес в избранное для удобства доступа

Переходим в избранное:
И вставляем этот адрес настроек туда:
Далее на рабочем столе в разделе избранного можно легко добраться до настроек конкретного профиля.